Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms