Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms