Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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