Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF19Q9UMS4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms