Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFU1Q9UMS0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFU1Q9UMS0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms