Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms