Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NRXN1Q9ULB1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
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