Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT11Q9UKZ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT11Q9UKZ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms