Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIMS3Q9UJD0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms