Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAX2Q9UIW0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms