Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms