Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms