Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms