Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC46.71■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.07
CCDC180Q9P1Z9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
CCDC180Q9P1Z9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC46.61■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC46.6■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
CCDC180Q9P1Z9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC46.55■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms