Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHRF1Q9P1Y6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms