Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMOD3Q9NYL9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD3Q9NYL9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms