Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR7Q9NYK1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR7Q9NYK1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms