Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms