Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms