Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH5Q9NX47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH5Q9NX47 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH5Q9NX47 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms