Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMLHEQ9NVH6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms