Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG3Q9NT62 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG3Q9NT62 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms