Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC52A3Q9NQ40 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.2 ms