Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP13A2Q9NQ11 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP13A2Q9NQ11 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP13A2Q9NQ11 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP13A2Q9NQ11 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP13A2Q9NQ11 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms