Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPCPD1Q9NPB8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms