Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLSPNQ9HAW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLSPNQ9HAW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLSPNQ9HAW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLSPNQ9HAW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSPNQ9HAW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms