Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN28AQ9H9Z2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms