Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD3Q9H7E2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TDRD3Q9H7E2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms