Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC134Q9H6E4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms