Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDGFDQ9GZP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
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