Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP1Q9C000 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms