Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms