Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4Q9BZE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP4Q9BZE4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms