Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL1Q9BYD6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL1Q9BYD6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms