Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms