Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD3Q9BV44 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms