Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR18Q9BV38 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms