Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PAGR1Q9BTK6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms