Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms