Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS4Q9BT78 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms