Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms