Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BARD1Q99728 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BARD1Q99728 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1
BARD1Q99728 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BARD1Q99728 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BARD1Q99728 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARD1Q99728 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BARD1Q99728 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARD1Q99728 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARD1Q99728 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARD1Q99728 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BARD1Q99728 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARD1Q99728 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARD1Q99728 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARD1Q99728 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARD1Q99728 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARD1Q99728 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARD1Q99728 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms