Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD5Q99666 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD5Q99666 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD5Q99666 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms