Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RMDN3Q96TC7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RMDN3Q96TC7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RMDN3Q96TC7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms