Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBL7Q96S82 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL7Q96S82 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL7Q96S82 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBL7Q96S82 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBL7Q96S82 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBL7Q96S82 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBL7Q96S82 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBL7Q96S82 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBL7Q96S82 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL7Q96S82 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms