Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WRNIP1Q96S55 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
WRNIP1Q96S55 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WRNIP1Q96S55 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms