Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGS1Q96RS0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGS1Q96RS0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms