Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH12Q96NR8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms