Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms