Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNPC3Q96LT9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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