Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PKNOX2Q96KN3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms